两仪微尘阵的完全版本在峨眉山，由太清一气神符镇压，这个是不能移动的。
此阵来自九天太虚仙府，原本在凝翠峰上，长眉真人从中参悟出来。
其布置万分繁琐复杂，没有几十年时间难以布成。
可一旦架设完成，作为蜀山世界第一仙阵，威力自然也是无穷无限的，能够在两仪芥子之中演化洪荒世界。
长眉真人当年捉拿邓隐，灭杀谷辰，用的都是简化版本。
他飞升以后，东海三仙合力炼制了六颗宝珠，十二杆旗门，可以携带外出，随手布置。
原著中，他们怕绿袍老祖身外化身逃跑，特地集体出动，带着宝珠和旗门把绿袍老祖所在山头罩在里面，接连炼了十九天，才将绿袍老祖炼化，形神俱灭。
昔日管明晦渡劫，他们也要带着这套东西去炼管明晦，半路上为叱利老佛阻挡，没有成行。
后来玄真子在铜椰岛死在管明晦手上，他的那枚纯阳宝珠和两杆旗门也被管明晦得到。
当年峨眉山三老在王屋山修炼，获得《九天玄经》，这本来就是一部完整的，可以一直修到天仙的书。
后来他们把这部书定为中册，与自己原本修炼的仙法，共同合编成一部《紫青宝篆》，后来长眉真人又往里面加了不少东西，其中就有两仪微尘阵的炼法。
玄真子作为大师兄，是将大部分都学全了的，但是他又不是教主继承人，还是有些部分没有得到。
唯有齐漱溟，在将来峨眉开府以后，将剩下的部分取出来，带领师兄弟们共同参修，算是给了齐漱溟掌教的正统地位。
但就算这样，最终除了齐漱溟能够百分之百学全，其他人多多少少还是会差一些学不到。
管明晦收了玄真子以后，相当于得到了全本的《九天玄经》，还有太清玄门有无形剑气，以及两仪微尘阵这两样自己最感兴趣的东西。
在后来的日子里，他在紫云宫除了五色神光这个最主要的功课之外，一有空闲就研究这些东西。
毕竟他跟峨眉派还有斗剑之约，两仪微尘阵是峨眉派的杀手锏，上次就差点出动，将自己逼入绝境，他怎么能不仔细将其研究透彻？
等到玄真子彻底被炼成了九转神幡上的主神，管明晦就跟他合力炼制布阵的法器。
那六颗纯阳宝珠的版本炼制起来工程太大，而且得有至少精通两仪微尘阵的三到六人合炼，他也凑不齐。
于是，他就炼制了更简化的版本十二都天宝篆！
原著中，荀兰因将其炼成以后赐给李洪，只有十二杆旗子，随身携带，一个人就能使用，放出来化作六座旗门，布成阵法。
李洪用它抵御苍虚老人的攻击，可以说是万邪不侵。
管明晦跟玄真子炼制的，介乎于三仙二老和荀兰因两个版本之间，也有六颗纯阳宝珠和十二宝篆旗子，可以一个人自己用，也能六人同使。
玄真子知道哈哈老祖化身已到，必须得六人同使才能牢靠，于是把六颗宝珠取出来，分给灭尘子和昆仑派四位剑仙。
这两仪微尘阵的门户运转之秘，他没有说出来，只告诉了他们宝珠的使用方法，到时候自己一个人操控全阵，他们五个帮忙镇守门户便可。
知非禅师等人对于两仪微尘阵也是久闻大名，接过宝珠，听玄真子告诉他们该如何应用，如何随阵法变化而衍生出三千六百手法诀，都听得认真无比。
灭尘子当年也学过，但好些地方都不能完全领会，这时候得大师兄指点，方才猛然领悟。
大家演练阵法，直到深夜。
眼看着亥时已至，夜幕之上，星月全无，天地之间漆黑一片，伸手不见五指，这时又刮起了大风。
风同时从南北两面吹来，气流到慈云宫处对撞到一起，形成浑沌气团，再往东西两个方向发泄。
“妖人要来了，咱们开始准备起来吧！”
玄真子已经成了这慈云宫的主事之人，灭尘子也听他号令，各自带着宝珠行到各自的方位上。
玄真子主持中央幻门，让天池上人主持东北死门，知非禅师主持西南生门。
钟先生主持西北明门，灭尘子主持极南晦门，苍髯客程迪主持极东的灭门。
他站在慈云宫中心方位，祭出那枚宝珠和两杆旗子，他这套是三仙二老原装的，威力最大，宝珠和旗子升空以后，便即消失不见，接着他又祭出另外十杆旗子，飞到对应的方位上，灭尘子等人祭出手上的宝珠，珠旗相合，接着也一起隐去。
此阵才刚架起，还未发动，慈云宫周围的邪风恶煞便消停了，阵外面依旧呼呼风啸不止，里面却是一片安静，连点风丝都没有。