离开这个世界之前，袁大古发出了一封邮件，那是送给这个世界的人类反抗军的。
那些脱离了矩阵的人类，会靠着磁悬浮飞船在城市的管道网络中四处游走，躲避着机械哨兵的围堵，在安全的时候通过私人的信号接入矩阵当中，去找寻那些思维活跃、认知到虚拟世界似乎是虚假的人，并带他们从矩阵世界中脱离出去。
袁大古需要与他们接触，因为与机器的战争中，他需要士兵，与其唤醒那在生物发电厂里沉睡的人类，还不如找现成的，也就是生活在现实世界中的人们。
锡安，人类最后的城市，二十五万的人口。
没有意识到世界真相的人们，是看不懂袁大古所留下的邮件，而真正的反抗军，则会从那邮件中了解到真正的信息，然后在现实中找到袁大古。
虽然是拿这些人当做士兵，投入到与机器的战争当中，但，袁大古的做法，实际上是在拯救他们，因为人类的灭亡是一种必然，给予他们反抗的机会与能力，反倒是为他们创造一丝生机。
矩阵系统的运行，会产生冗余数据，而这些冗余数据，便是那些思维活跃人类。
系统想要长久地运行，就是需要把这些冗余数据给删除掉，但是把这些人类找出来却是一件非常困难的事情。因此，作为矩阵的创建者之一，代号为“先知”的程序主动帮助人类，将一部分觉醒了的人类从矩阵世界释放，教给他们各种知识，帮助他们建造属于人类的城市，教会他们如何如何战斗，以及如何在矩阵世界找到觉醒者，带他们离开矩阵世界。
让冗余数据来处理冗余数据，大大延续了矩阵世界的运行，并且，人类在现实世界中建立的城市，本质上就是矩阵世界设置的一个垃圾站，等到了固定的时间，就会对垃圾站进行清空的处理。
也就是从物理层面杀掉所有的人。
虽然表现出人类盟友的姿态，但，先知始终是站在机器文明这一边的，在矩阵重启清理垃圾站之前，人力反抗军所能做的，只是不断地躲藏，而锡安这座城市，也只是苟延残喘。
曾经的人类拥有着整个世界，有着几十亿的人口，有着庞大的军队，还有完整的工业体系，尚且败在机械文明的手中，沦为了作物一般的存在。
靠着锡安那么点的人口，人类失败的命运是必然的——电影中，人类的救世主尼奥与机械文明的主导者，那由所有的人工智能组成的蜂巢意识机械大帝的交易，属于可遇不可求的事情。
袁大古的意识回归到了身体当中，他有不得不回到现实的理由。
因为袁大古而引起的骚乱，不仅仅是出现在矩阵的虚拟世界当中，现实世界中，一场属于机器人之间的战斗，已经悄然打响了。
当然，真正算起来，这只是局部冲突的层次。
机械文明已经接收到了关于袁大古的情报，那电流病毒，以及正负磁极阴阳手改写机器人底层逻辑的能力，而关于矩阵世界内的情报，袁大古与机器文明之间的“战争游戏”，也被机器文明所知晓。
在矩阵内的交易达成的时候，战争就开始了，机械文明正式地投入了兵力介入战争当中。