从衣兜里拿出了一个药盒，打开之后，墨菲斯把一红一蓝两枚药丸展示给尼奥：“虽然打败了电脑特工的你现在已经没有选择的余地了，但，这是一个必要的程序，选择蓝色药丸，你会忘记今晚发生的一切，忘掉我们；选择红色药丸，你将会回到现实世界，去真正地活着。”
没有犹豫，尼奥选择了红色药丸，吃下去之前，他想到了一句话，并把它送给了墨菲斯：“我想要了解生命的意义，我想要真正地……活着。”
药丸的选择，只是一个开始。
尼奥被带到了另外一个房间，在这里，有着很多尼奥看不懂的装置存在，他被要求躺在一个椅子上，身上贴上了电极片。
之前尼奥见过的苏薇琪、赛弗、崔妮蒂都在这里忙碌着，操控着仪器，还有几个他不认识的人在这里。
“你吃下的药丸，是一套追踪程序，它可以让矩阵产生误判，认为你已经死亡……同样的，也可以帮助我们确定你位于现实世界中的位置。”墨菲斯这样说到：“第一次见到世界的真相，你可能有些不适应……例如，感到一些冰冷。”
“因为你的各项感知，是第一次工作，是真正地靠着自己来认知这个世界，而非矩阵给予大脑的幻象。”
“冰冷？”
随着时间的推移，冰冷，抖动，尼奥有熟悉的感觉出现在身上，每一次进入那个主神空间里，都是这样的感觉：“就是这种感觉！”
“每一次去往那个主神空间，我都是这样的感觉！”
尼奥把自己的感受向墨菲斯说了出来。
然后，尼奥的身影消失在了众人眼前，墨菲斯几个人手边有一部有线电话，那是他们离开这个矩阵世界的“门户”。
尼奥的意识回归到了现实世界，他们必须尽快把他找到。
就像一个长期卧床的病人，身体机能都是退化了的，从出生到现在，尼奥的身体都是不曾运动过的，非常脆弱，如果没有专门的医疗康复手段，他根本活不去下去。
而现实世界中的尼奥猛地醒来，他钻出了培养仓，真正地在现实中醒来。
他观察着四周，看着自己，发现眼前的一切都是那样的似曾相识，他在进入主神空间的时候，那个封闭的小房间，与现在自己所看到的场景几乎是一模一样，而自己，就是那个在培养仓里沉睡的人。
“我早已经窥见世界的真相，但是我不曾了解！”尼奥在心中这样说到，因为一根饲养的喉管让他根本无法说出口。
……
在尼奥的意识脱离了矩阵世界的时候，袁大古就已经感知到了，接收到了信息。
这些被他选中的轮回者，他都是有额外的标记的，尤其是尼奥这个私服玩家，更是被重点关注的，他被从矩阵世界中解救出去，就代表墨菲斯找到了他的的“救世主”。
只是……