一次跨越维度的、基于现实需求的合作，就此初步达成。
虽然信任的基础依旧脆弱，但共同的敌人和生存的需求，将两个原本毫不相干的世界势力，暂时联系在了一起。
合作框架的建立为WILLE带来了希望，但个体的创伤却需要时间愈合。
连日的高压战斗和颠覆性的真相揭露，让两位年轻的EVA驾驶员状态低迷。
明日香虽然依旧强撑着执行巡逻和训练任务，但往日的张扬与活力明显黯淡了许多。
她常常一个人呆在格纳库，看着白色的三号机出神，或者在休息时望着窗外满目疮痍的城市废墟，眼神中带着难以掩饰的疲惫和一丝迷茫。
战斗的意义，自身的价值，在知晓了SEELE的阴谋和NERV的黑暗后，似乎都变得模糊起来。
陈瑜在一次例行技术检查后，在三号机的格纳库找到了她。
明日香正坐在高处的维护平台上，双腿悬空，看着下方安静的白色巨人。
“还在想量产机的事情？”陈瑜走到她身边，声音平和。
明日香没有回头，只是低声道：“博士……我们做的这一切，真的有意义吗？就算打败了SEELE，这个世界……也已经变成这个样子了。”
她挥手指向窗外，“而且，我们战斗的力量，EVA，本身也……”
她没有说下去，但陈瑜明白她的未竟之语。
EVA与使徒同源，其力量本身就充满了矛盾和原罪。
“意义并非天生存在，而是由行动者赋予的。”陈瑜看着下方的三号机，“你阻止了莉莉丝的苏醒，保护了总部，歼灭了来犯的敌人。这些是你切实做到的。
SEELE想要剥夺人类选择的权力，而你的战斗，正是在守护这份权力。至于EVA的力量，工具本身并无善恶，关键在于使用它的意志。”
他顿了顿，看向明日香：“你做出的选择，你付出的努力，你守护的东西，这些就是你存在的意义，并非由你的出身或你驾驶的机体决定。你做得很好，明日香，远比你自己想象的要坚强。”
这番肯定的话语，像是一股暖流，注入了明日香冰冷而迷茫的心湖。
她抬起头，看向陈瑜，眼中似乎恢复了一些神采。博士没有用空洞的大道理安慰她，而是肯定了她的行动和价值。
然而，就在明日香情绪稍有好转后不久，一场更大的风暴向她袭来。
赤木律子领导的技術团队在彻底梳理中央教条区数据库和设施时，不可避免地触及了那些被列为最高机密的区域。
其中，就包括了位于中央教条区深处、一个未被完全摧毁的“绫波丽”克隆体培育单元。
在一次数据同步和汇报会议上，一份关于“式波系列”的残余档案，因为系统关联，被意外地显示在了明日香也在场的战术简报屏幕上。
那上面清晰地标注着“式波·明日香·兰格雷”的代号，以及其作为“适格者备份计划”一部分的说明，旁边甚至还附有一张与她容貌极其相似、但眼神空洞的另一个“明日香”在培养槽中的静态图像。