长航最大的问题来自于长航本身的危险性和对身体的危害性。
90昼夜的航行，出恶性事故的几率非常大，超剂量的辐射、有害气体和上百分贝的噪音对人体伤害极大。
当然，要参加这么重要的任务，部队给的待遇也不可能低了。
所有参试者通过长航，干部可能得到提拔重用，很多人会成为核潜艇部队的领导干部乃至舰队、海军领导干部的接班人；
志愿兵可转干，为家属随军创造条件；战士、老兵可以转为志愿兵，符合条件的战士，可照顾报考院校；
要求入党的艇员可以在长航中火线入党，或分期分批入党。
所有参试者都将载入海军史册，立功受奖；所冒的生命危险和所受的身体损伤，上级部门会给予一定的物质补偿。
在出发前，所有艇员都在集中学习“为人民服务”“纪念白求恩”“雷锋事迹”等篇章，以增加艇员的士气。
勤务部门还有领导过来讲辐射剂量课、营养课、海上保健课。
半个月的学习后，效果显著，艇员们上交了一百多份决心书和建议。
39名老战士自愿超期服役，70名团员递交了入党申请书，21名干部推迟休假，还有人推迟了婚期。
如此，在精神和物质的双重准备下，年底的最后一天，403号艇才正式出航。
每天早上，五指-1岗位（机电长值更岗位）会拉响蜂鸣器，广播：“艇员起床！”
照例传出常同志的声音：“同志们，早上好！今天是X月X日，出航第XX天，封舱第XX天。我们离完成任务90昼夜还有XX天，我们在水下长征的征途上又迈出了一步！”
第一阶段的测试任务包括封舱试验，即潜艇下潜后，在与大气隔绝的情况下水下航行，海军下达的任务目标是20昼夜。
出航21天、封舱16天后，艇员开始出现疲劳，机械隐患也开始增多，反应堆运行产生的放射性尘埃浓度也在逐渐增加。
成千套机械运转产生的废气、艇体的油漆挥发、一百多人的呼吸和新陈代谢、做饭的油烟等，核潜艇内的有害气体有上百种，能定量监测出来的就多达80来种。
长期与大气隔绝，使得舱室中的有害气体越来越多。
第一个月精神心理压力最大，最为难熬。不见天日的水下生活会让人一觉醒来陷入茫然，迟钝麻木，分不清是早是晚。
每天早上，人人都抢着去撕指挥舱的月份牌，渴望一天快点过去。
副艇长蒋同志在日历上写了一句话：“你撕不如我撕，一天只能撕一张。”
有人对了下联：“我快不如你快，一天还是一样快。”横批：“度日如年。”
为了维持战士们的士气，潜艇里面当然会有很多娱乐设施。
其中，鱼雷舱就被当做“电影院”和“舞厅”。
鱼雷架上支起了床铺板，可以用来跳舞，每天晚饭后和放电影前，年轻的战士们都会来这里跳迪斯科。
组织科干事李成和鱼电班长张东会用一台录像机录下每天发生的典型事迹和好人好事。