第二次南北战争来得快，去的也快，美国政府领导的第二支部终究还是被SEELE控制的第一支部呼叫“场外势力”给击败了，北美安全区也正式宣布灭亡，这里所有的残存人类都被SEELE从反L系统中拖出来核化了。
虽然手段在普通人看起来十分残忍，但从SEELE的视角来看，这些被核化的人类完全可以说是“坐享其成”，因为核化之后只相当于被“净化”了，剩下的委员会成员们则还需要加班加点辛勤地工作，直到彻底完成人类补完计划回归“天堂”为止。
这片原本被两洋环绕的“天赐之地”，也终于完全被第三次冲击的余波所“净化”，而徘徊在这片大地之上的，也只剩下了无头的“游荡者”们。
在明面上，SEELE到现在为止已经几乎掌控了一切，整个地球只剩下了一个上海支部在当地政府的领导之下“苟延残喘”。
而在获得了第二次南北战争的胜利，并且夺取了北美第二支部所有资源的情况下，SEELE不认为自己会输，东大在委员会看来只是苟延残喘罢了，就算是他们建好了忏悔号又能如何？
委员会的手里的牌吗，算上正在舾装测试的三号舰原罪号，可是有三艘星舰的，更何况所有星舰的“主人们”，目前全都捏在SEELE的手里，这些老登根本想象不到自己会怎么输！
可惜人算不如天算，青子等人回到伯大尼基地就像是回家一样随意，两台安装了使徒核心的拟神化EVA往天上一挂，就吸引走了全部人员的注意力。
失去了EVA五号机的伯大尼支部，就如同手无寸铁的小姑娘，面对全副武装的阿斯塔特一样无力，青子等人在橙子这个“带路党”的帮助之下，轻而易举地就找到了正在进行最后舾装的原罪号星舰。
“苍崎橙子！”支部主管咬牙切齿地看向橙子，不甘地说道，“组织和我都对你不薄，你为何要背叛我们！”
“这可谈不上背叛，主管阁下，”橙子颇为有派头地挥了挥手指表示否定，这个动作在她头顶光环漂浮在半空中的状态下看起来特别有压迫力，“我不是也向伯大尼支部贡献了那么多研究成果吗？我们之间只是相互利用的关系，大家好聚好散嘛。”
“委员会不会放过你们的，苍崎！”阴鸷表情的高层恨恨地说道，“北美第二支部已经败了，等上海支部被解决之后，下一个就是你们！即使你们占领了伯大尼支部，也没办法对抗委员会！”
“呵呵，那就不用你们担心了，我们自有办法，”青子笑眯眯地说道，“原罪号就由我们笑纳了，诸位把她建造的非常漂亮，我非常满意...好了橙子，可以把你的老同事们都挪个窝了。”
说完，这些残留在伯大尼支部的员工们就都被橙子的人偶们带走了，他们被通过传送门送去了蓝宝石花之乡的地牢里关押了起来。
青子并不会干掉他们，作为各个领域学科方面的专家，青子打算在清除掉他们身体中的神秘学防护之后，再用魔法和魔术对他们彻底洗脑，最后再扔到PRIMA基地里继续发光发热。
而且为青子她们这伙人工作还有个好处，延寿的手段她们有的是，这些优质牛马在青子的手下恐怕将来永无退休之日，会一直工作到天荒地老。