崇祯五年六月，河南发大水，周王新修缮的大坝也还是没有顶住，黄河决口，淹没开封府大部；
陈州、睢州涡河、惠济河泛滥成灾；杞县、通许地势低洼，积水难泄；归德府东部永城、夏邑黄河支流沱河、浍河溢流；郑州、中牟、原武，豫北部分地区，潞王封地卫辉府，卫河、淇水汛期暴涨，淹没城郭。
五六月正是夏收季节，河南是北方重要粮产区，没有来得及收割的粮食作物直接被泡坏，已经收割但还没有晒干的粮食被冲进河道喂鱼。
各府县灾情上报请求赈灾的文书成沓送来，坐镇南京的朱由检看着这些东西，只有深深的无力感：早就跟河南布政使司的官员交代过要防灾，但没有用，到最后也做不了什么。
以大明现在弱到爆的动员能力，组织一个县的百姓迁徙都费劲，人家朱重八可以百万移民实边，不代表着朱由检可以做到
各州府对于灾情给予的都是很模糊的奏报：什么“积水三尺，淹没五城，受灾甚重，淹死妇男甚多”，甚多是多少，倒是说啊！但他们不是不想说，是说不了，因为他们也不清楚到底淹死了多少人。
下游山东的州府汇报，在黄河里面发现有很多浮尸，捞起来却找不到辨识身份的东西，只能就地烧埋，陆陆续续已经不下千人了！
六月，北直隶开始下雨；八月，再次强降雨，洪水冲损庆陵，工部奏道：“我们知道皇帝你节俭惯了，打仗花钱大手大脚，对自己人却抠抠搜搜。
大臣们将家里的嫡女嫡孙女嫁给你，是想图个富贵，结果这些妃嫔回来省亲的时候，跟饿了八百年的饿死鬼一样，拼了命地在家里面刮地皮，却从来没有见从皇宫里面带回来东西的。
现在就问你，要不要拨款修庆陵，还是让你大爹刚下葬没几年就曝尸荒野？！”
朱由检差点被气得驾崩，但也只能含泪签署了同意修缮庆陵的公文，总不能真让朱常洛被冲到河里面喂鱼吧？！
就在北方频频报水灾的时候，南方竟然开始闹旱灾了，真就是见了鬼了！杭、嘉、湖三府自八月至十月七十天没有下雨，南方核心粮产区的第二季稻直接报废！
南旱北涝，还有各地刚刚冒头、没有出现大范围大规模迁徙的蝗灾，全国粮食减产，多地开始闹饥荒。
在这种情况下，朝廷的全部精力都要用于维稳，已经错失了迁都的时机。
十月底，南巡了一圈的朱由检回到京师，京师官民喜极而泣、奔走相告！